คณะรัฐมนตรีได้มีมติเมื่อวันที่ ๒๐ สิงหาคม ๒๕๓๔ อนุมัติให้กระทรวงเกษตรและสหกรณ์จัดตั้งสำนักงานเกษตรและสหกรณ์จังหวัด โดยให้มีการทดลองจัดตั้งขึ้น ๔ จังหวัด ที่มีสำนักงานเกษตรภาคตั้งอยู่ก่อน
คือ จังหวัดเชียงใหม่ จังหวัดขอนแก่น จังหวัดชัยนาท และจังหวัดสงขลา
ต่อมาในปี ๒๕๓๗ กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ร่วมกับสำนักงาน ก.พ.ได้ทำการประเมินผลการปฏิบัติงานของสำนักงานเกษตรและสหกรณ์จังหวัดทั้ง ๔ แห่ง ผลารปฏิบัติงานอยู่ในระดับ ที่น่าพอใจ คณะรัฐมนตรีจึงได้มีมติเมื่อวันที่ ๑๓ กันยายน ๒๕๓๗ เห็นชอบให้กระทรวงเกษตรและสหกรณ์จัดตั้งสำนักงานเกษตรและสหกรณ์เป็นการถาวรได้ โดยให้รวมงานด้านการปฏิบัติการของหน่วยงานในสังกัดจังหวัด เข้ามาอยู่ภายใต้การกำกับดูแลกระทรวงเกษตรและสหกรณ์จังหวัด ภายใน ๓ ปี
ดังนั้นกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ จึงได้จัดตั้งสำนักงานเกษตรและสหกรณ์จังหวัดขึ้นเป็นราชการบริหารส่วนภูมิภาค สังกัดสำนักงานปลัดกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ตามพระราชกฤษฎีกาแบ่งส่วนราชการ สำนักงานปลัดกระทรวงฯ กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ พ.ศ.๒๕๓๘ ประกาศในราชกิจจานุเบกษาฉบับกฤษฎีกา เล่มที่ ๑๑๒ ตอนที่ ๖ ลงวันที่ ๗ กุมภาพันธ์ ๒๕๓๘
สำนักงานเกษตรและสหกรณ์จังหวัดกระบี่ ได้จัดตั้งสำนักงานเมื่อ เดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ.๒๕๔๑